2018.7.19-7.22生物信息学软件与工具使用培训班

作者:admin 发布于:2018年5月12日 阅读次数:2584

工欲善其事,必先利其器”,对于从事生物信息学研究,软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用,但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问,如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用?对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍?为了解决您遇到的困扰,打开您的思绪,北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用,通过实际项目演练,学习常用分析软件的使用方法,将课程各项知识点融会贯通,从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧!一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来!

授课对象: 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
           
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
           
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
           
中国生物工程杂志
           
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

            北京微生太科技有限公司

            北京依托华茂生物科技有限公司
地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼,北京市计算中心三层会议室。
培训时间: 2018.7.19-22(共4天)  9:30-12:00 13:30-17:00

培训内容及安排:

日期

时间

课程名称

课程内容

719

09:30-

10:30

生物信息学概述与前沿

1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍

2. 生物信息进展与前沿技术介绍

10:30-12:00

NCBI数据库

NCBI数据库介绍:PubMedNucleotideGenBank)、GenomeStructuresMMDB)、TaxonomyUniGeneEntrez等,数据查询检索

13:30-15:00

NCBI数据库

2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载

3. NCBI数据库实例讲解与练习

15:00-17:00

Blast与序列比对

1. Blast与序列检索比对及参数

2. Blast建库与Blast本地化

3. 实例讲解与练习

719

09:30-12:00

MEGA软件与分子进化

1. 分子进化理论基础

2. MEGA与系统发育树构建

3. 实例讲解与练习

13:30-17:00

分子网络与生物学通路分析

1. 分子相互作用数据库与通路概述(UniprotStringDIP数据库)

2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用

3. 实例讲解与练习

719

09:30-12:00

基因组注释

1. 基因本体数据库GOGO注释

2. 生物学通路KEGG注释方法与实现

3. David与基因注释

4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建

13:30-15:30

疾病和基因突变数据库

1. GeneCard数据库介绍及使用

2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用

15:30-17:00

药物基因组数据库

1. PharmGKB数据库介绍及使用

2. PGMD数据库介绍及使用

719

09:30-12:00

表观遗传学

1. Encode数据库介绍及使用

2. Roadmap数据库介绍及使用

3. RegulomeDB数据库介绍及使用

13:30-15:30

蛋白质3D结构

1. 蛋白质结构分析概述

2. PDB数据库介绍与使用

3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用

15:30-17:00

SPSS软件与生物统计应用

1. 生物统计概述

2. SPSS使用与生物统计应用

3. 实例讲解与练习

【注】以上课程信息实际上课为准

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

【收费标准】培训费:4000元,含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理,酒店自行预定。

【报名优惠政策】

1、6.30日前报名并缴费可优惠200

2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式】

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

    号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名+单位”)

请联系

QQ号:1103246565

王老师:010-52068621  13641189909(微信同号) 邮箱:Paragonbio@163.com

【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询