2018.7.23-7.25基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班

作者:admin 发布于:2018年5月12日 阅读次数:1384

随着深度测序技术的发展与成熟,产生了海量的基因组的数据,通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。北京市计算中心举办《基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班》,目的就是为统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台,并为今后的项目交流和相互合作创造条件。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
           
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
           
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
           
中国生物工程杂志
           
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

            北京微生太科技有限公司

            北京依托华茂生物科技有限公司
地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼,北京市计算中心三层会议室。
培训时间:2018.7.23-25(共3天)  9:30-12:00 13:30-17:00

培训内容及安排:

日期

时间

课程名称

课程内容

723

上午

生物信息学概述及NGS原理与应用

1.生物信息学知识背景概述

2.二代测序(NGS)的基本概况和技术发展简介;

3.NGS建库原理与技术;

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用 (上机操作)

1.linux基础与基本操作;

2.生物信息学软件应用及常用软件介绍

3.重测序相关分析软件介绍及安装

724

上午

基因组重测序技术应用理论与策略

1.基因组重测序的理论与研究方法及意义

2.全基因组数据分析策略

3.全外显子数据分析方法与应用

4.目标区域测序的策略应用与技术前沿应用

下午

基因组变异分析 (上机操作)

1.重测序的分析流程

2.原始测序数据的质控及过滤

3.学习BWAsamtools等工具的使用,进行calling SNP,INDEL

4.sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析

725

上午

基因组变异分析 (上机操作)

1.利用重测序数据检测拷贝数变异(CNV

2.利用重测序数据检测易位、转置等结构变异(SV

下午

基因组变异注释与功能分析(上机操作)

1.基因组注释工具Annovar的应用

2.基因组变异数据库GenecardHGMD等以及功能分析的应用

3.药物基因组学与靶向药突变位点查询

4.基因组变异位点筛选与过滤分析

 

【注】以上课程信息实际上课为准

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

【收费标准】培训费:4000元,含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理,酒店自行预定。

【报名优惠政策】

1、6.30日前报名并缴费可优惠200

2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式】

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

    号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名+单位”)

请联系

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王老师:010-52068621  13641189909(微信同号) 邮箱:Paragonbio@163.com

【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询